改革开放三十年，中国高校，已走到十字路口。向左，是数年来盲目扩招造成的累累恶果；向右，是与国际名校看齐过程中的重重阻力。教育体系生病，家国与个人皆无法独善其身。当“蚁族”“就业难”“大学生二奶”等问题频频拷问中国的大学教育模式的时候，变？还是不变？这个与整个国家和民族的现在与未来都密切相关的问题，值得我们每一个人深思。
墨守旧体制的弊端，我们已有切肤之痛，若要改变，新路又在哪里？利益板块已经结成，谁能成为死而后己的探路者？朱清时，一个自称“怀着高校改革梦想的理想主义者”，在深圳，开启了改革之梦……
此时，距朱清时离开中科大校长岗位已一年有余。一年多的时日里，朱清时以年过花甲之躯上蹿下跳使尽浑身解数，仍旧没能解决南科大的审批难题，甚至，没有哪怕仅仅一个，大学校长，站出来对他进行声援[…详细]。朱清时陷入了一个看不到形状的包围圈，他曾在酒后说，这一年他学会了以前做10年中科大校长都不懂的事——妥协。当年离开中科大时，朱清时说：“做校长，重要的不是我做了什么，而是没做什么。”但今日显然已不同于往昔，这个中国高校圈里公认的“个性校长”，在坚持了十年不扩招之后，如今却被招生的难题困住。
朱清时学实验物理出身，信奉“一个改革的行动，胜过一打改革纲领”。他希望在南方科大这张白纸上，推行一场没有历史负担的改革试验。但试验的难度让他始料未及。“一年中，我有数次陷入不知道该怎么办的状态，觉得我可能真的做不到，心有余而力不足。”朱清时对南方周末记者说。
第一个险些迈不过去的坎，是学校如何得到教育部的承认。
办南方科大，不过是深圳市的“一厢情愿”，没有得到教育部的认可，甚至被一些人认为“胡闹”。
朱清明一次一次地通过媒体，告诉公众自己的改革设想，同时也积极疏通各方关系。2009年12月底，他利用在横琴岛参加澳门大学新校区奠基仪式的机会，与新任教育部部长袁贵仁作了沟通，争取他的支持。从去年底至今，教育部长袁贵仁、副部长鲁昕等人，都表示支持南方科大“做中国创建世界一流大学的试验”。鲁昕还说：如果事事都要上级批准，那就不可能有改革。但中国事情的复杂性就在于，得到上级批准，难；但上层领导表态了，也并不意味着事情可以变得顺利。朱清时说：“后来的实践使我认识到，部长的态度，不等于教育部批准。”
2007年深圳市已和教育部进行沟通，一直没有结果。对于设置大学的申请，教育部一年只开一次会讨论。在朱和深圳市多方努力之下，今年9月，教育部为南方科大“开先例”，专门开会研究南方科大问题。“这是他们对我们的照顾了。”朱清时说。
不仅仅是与教育部，南方科大与深圳市也在碰撞中磨合。
今年初，在深圳市政府协调下，南方科大从南开大学金融学院接手了一个校区，不料存在建筑物漏水问题。按规定，修缮工程要经过评估、审批、立项、招投标、拨款等繁琐的步骤，几个月后才得以动工。同样，朱清时想给办公室配一台电脑，也要走至少两个月程序。好在市政府全力支持，决定“网开一面”：给南方科大每年一千万元机动经费，校方可以不走程序，自由决定将这笔经费用到需要的地方。
校址确定后，需要制定教师队伍薪酬制度。朱清时制定方案，学校领军教授的年薪，从115万元人民币起步，舆论迅速热炒。这个薪酬数字，在国际人才竞争中并不是特别有吸引力。但作为深圳市政府全资建设的公立大学，南方科大的“出格”薪酬，直接影响了深圳市的整体薪酬体系，一时间议论纷纷。
几个月后，这一薪酬标准才得到政府各部门的认可。
招生路上多坎坷
校区准备好了，教师来了，学生呢？
招生问题，成为过去的一年里南方科大迈不过去的槛。
第一个拦路虎，是国务院一份名为《普通高等学校设置暂行条例》的文件。这份文件发布于1986年，到现在已“暂行”了24年。《条例》第17条规定：“设置普通高等学校的审批程序，一般分为审批筹建和审批正式建校招生两个阶段。”朱清时在中科大当了10年校长，还是第一次听说这个条例。开始他以为教育部批准后，就可以招生，没想到教育部批复“筹建”。而从筹建到正式建校招生，需要一到五年时间。“不亲自去组建一个学校，就根本不知道中国有这么多教育的规章制度，不知道卡得这么死。”朱清时感叹。
他有些后悔：早知如此，南方科大应该坚决跳过筹建步骤，申请正式建校招生。然而，想要“跳级”，也没那么简单，得满足条例所设置的许多严格条件。例如，在校学生计划规模不能少于五千人，图书不能少于六万册，等等。
南方科大永久校区刚开工，年初得到的启动校区内，仅有四栋建筑物，第一年招生计划仅50人。要想获批正式建校，可能性微乎其微。但是，对于南方科大来说，只有招生了，试验才能真正启动。经过争取，教育部允许南方科大与中科大联合招生。这已经是为改革试验开绿灯——以往，尚在筹建阶段的学校，连联合招生的资格都没有。
南方科大计划从报考中科大少年班落选的苗子里，挑选可塑之才。这时，另一道政策“紧箍咒”传来：联合招生的学生，都必须是中科大学籍。这让朱清时再次感觉“掉进了坑里”：“我们如果只是对中科大的学生进行异地教学，改革试验的意义就很小了。”